Farmakognozi Anabilim Dalı, bitkiler üzerinde analiz yapabilecek bir donanıma sahiptir. Çalışılan bitki örnekleri, fakültemizin Herbaryumunda saklanabilmektedir. Bitki örneklerinin ekstraksiyonu ve ekstrelerden metabolitlerin izolasyonu için gerekli donanım sınırlı da olsa mevcuttur. Ekstraksiyon için su banyoları ve elektrikli ısıtıcılar, geri çeviren soğutucular, evaporatörler (döner buharlaştırıcılar), liyofilizatör, kromatografi sistemleri (ince tabaka kromatografi seti, klasik kolon kromatografisi için çeşitli boyutlarda kolonlar ve fraksiyon toplayıcılar, preperatif likit kromatografi sistemleri, VLC, MPLC ve analitik-HPLC) bulunmaktadır. Doğal bileşiklerin yapı tayinlerinde gerekli olan fizik aletlerin bir kısmı fakültemizde (UV, FT-IR, LC-MS, Polarimetre) ve üniversitemizin diğer birimlerinde (NMR, 400 MHz) bulunmaktadır. İhtiyaç duyulan eksiklikler, disiplinlerarası çalışmalarla sağlanabilmektedir (bkz. Ilgili araştırmacıların yayın listeleri). Özellikle, glikozitler (monoterpen glikozitleri, iridoitler, triterpenik ve steroidal saponozitler, feniletanoitler, lignanlar, antranoitler ve flavonoitler) ve diterpenler başlıca araştırma konuları olup, birikmiş oldukça zengin doğal bileşik koleksiyonuna sahiptir.